（代理） 李健二教授（1997/02 - 1998/10）
（代理） 張保民教授（1998/11 - 2000/01）
第一任 薛天棟教授（2000/02 - 2003/01）
（代理） 謝文真教授（2003/02 - 2003/08）
第二任 陳振宇教授（2003/09 - 2005/07）
第三任 陳振宇教授（2005/08 - 2008/07）
（代理） 黃煌煇教授（2008/08 - 2009/07）
第四任 何志欽教授（2009/08 - 2012/07）
第五任 何志欽教授（2012/08 - 2015/07）
第六任 許育典教授（2015/08 - 2018/07）
第七任 蕭富仁教授（2018/08 - 2021/07）
第八任 蕭富仁教授（2021/08 - 2024/07）
第九任 蔡群立教授（2024/08 - 至今）